Принимаются предложения/замечания/вопросы.

На айпаде
проверял на iBouquiniste и KyBook
оба не работают

А интересно такое время на стандартной конфигурации (cover_extract = no) ?
Просто у меня Pentium-4-2800 270 тысяч за 10-11 часов сканирует.

Абсолютно верно
cover_extract = no
cover_show=0

- на Атлоне 2х2,8 Ггц
папка с книгами подмонтирована через самбу, HDD один из новых, может дело в этом.

Еще хотел добавить, что можно использовать обычный браузер, например Firefox, он нормально отдает книгу в FB2.

Предложение по расширению функционала.
После сканирования реальной библиотеки появляется куча неопознанных жанров типа: travel_africa, travel_lat_am, travel_spec. Которые все на самом деле должны быть adv_geo - путешествия и география.
Дмитрий, разработайте пожалуйста механизм по борьбе с этой ситуацией. Это может быть дополнительная таблица или в уже существующей добавить колонку - ссылку на основной жанр. Тогда сканер найдет жанр, увидит, что это дубль и проставит не ID этого жанра, а ID правильного.

Вот я нашел хороший файл с жанрами и указанием дублей.
github.com/lumag/JBookReader2/blob/maste.../genres_transfer.xml

Со своей стороны могу взять на себя подготовку скриптов по мягкому апдейту базы данных. Без необходимости повторного сканирования. 

Предложение по расширению функционала.

Про жанры согласен. Что-то хочется сделать...Но пока есть более первостепенные проблемы. Поэтому к Вашему предложению безусловно вернусь. Но после того как отлажу основной функционал OPDS.
На самом деле после всего этого планирую прикрутить еще WEB-интерфейс, там и можно будет выполнять различные вещи с книгами. Но это потом.

Conrad:Долго ломал Голову над этой проблемой. У меня к сожалению нет Apple-Устройств, Смартфоны и планшеты - все на андроиде.
На Адроиде EBookDroid сразу воспринял новый поиск на отлично, А вот FBReader выкидывал разные фокусы и искать отказывался... Долго искал ошибку, в чем я отступил от спецификации. Если честно так и не нашел. Оказалось что FBReader что-то скэшировал о старом формате поиска и ни в какую не собирался искать в новом формате, пришлось удалить OPDS-каталог и заново добавить (и на всякий случай еще кэш приложения почистить). После этого и FBReader заработал как надо.
Вероятно у Вас аналогичная проблема.
Отпишитесь пожалуйста, если это действительно так. К сожалению iBouquiniste и KyBook мне не доступны, чтобы проверить все самому.